“后湖历代相传为胜地，赵宋时废为田，元大德中仅一池。国朝复为湖，以贮天下图籍。”(明《万历应天府志》)从宋熙宁年间被废为田到明洪武年间再现京城(今南京老城)版图，经过300余年的洗礼，玄武湖最终以明朝国家级档案馆——后湖黄册库的面目呈现在世人眼前。那么，在这300年间，玄武湖经历了什么，金陵城又发生了什么呢?
增加良田200余顷
“真武湖，本朝天禧四年改为放生池。其后废湖为田，中开十字河，立四斗门以泄湖水，跨河为桥以通往来。今城北十三里有古池，俗呼为后湖，见作大军教场处是也。”关于玄武湖被废为田的记载最早见于南宋张敦颐的《六朝事迹编类》。“一水护田将绿绕，两山排闼送青来。”而王安石则是目前所知第一个描写废湖为田之后景象的。
玄武湖被废之前和被废之后又是怎样的一番情景呢?宋代两位著名诗人皆以诗证史，给出了答案。一位是北宋的欧阳修。欧阳修著有《采桑子》十三首，其中前十首用清新流丽的语言，专咏西湖风光，道尽“西湖好”。“钱塘莫美于西湖，金陵莫美于后湖。”也许，他只是玄武湖的一个匆匆过客，在无暇吟咏之余仅用一个经典的类比溢美。无疑，欧阳修遇见的还是一个旅游胜地。
另一位是南宋的杨万里。“毕竟西湖六月中，风光不与四时同。接天莲叶无穷碧，映日荷花别样红。”1187年夏天，杨万里在西湖边送别好友林子方时写下这首风靡天下的西湖代言诗。四年之后的一个夏日清晨，他来到昔日的“玄武湖”游历，写下了《夏日杂兴》：“金陵六月晓犹寒，近北天时较少暄。打尽来禽那待熟，半开萱草已先翻。独龙冈顶青千摺，十字河头碧一痕。九郡报来都雨足，插秧收麦喜村村。”“十字河”是王安石诗中的“一水”，也是废湖后玄武湖的象征，此时，玄武湖已是“钟山乡”，成为农田，不知道诗人心中有没有遗憾。
“城北关外有湖二百余顷。”彼时玄武湖面积有200多顷。南宋淳祐十年(1250)，“拨后湖田七千余亩，创义社，立规式，支助贫士之结凶不赡者。”(元《至正金陵新志》)显然，废湖为田给平民百姓带来了一些好处。
另外，玄武湖一部分成了军营。“当日湖光澈镜心，龙旗凤吹此登临。而今铁马回旋地，斜照黄尘一尺深。”南宋曾极在《玄武湖》一诗的序中强调“今为后军寨”，这与《六朝事迹编类》记载的“见作大军教场处”相互印证。
“田出麦谷利小，湖关形胜利大。”与王安石一样三任建康(今南京)知府的南宋名臣马光祖认为废湖为田弊大于利。对此夏仁虎在《玄武湖志》中讲得较为透彻：“金陵地势外高而中卑，玄武一湖，实受北山诸水，潴蓄失所，不旱则潦耳。”
废湖为田与建康水患
历代《上元县志》等对金陵城市水患多有记载，其中清《道光上元县志》记录得更为详细。“宋太宗太平兴国八年七月(983)，江水溢; 仁宗天圣四年六月(1026)，江淮南大水; 天圣六年七月(1028)，江宁府江水溢，坏官民庐舍;嘉祐元年五月(1056)，江溢;徽宗政和五年六月(1115)，江宁府水灾;重和元年(1118)，江淮水; 高宗建炎二年十月(1128)，霖雨;建炎三年六月(1129)，大霖雨;孝宗隆兴二年七月(1164)，建康大水，侵城郭坏庐舍;乾道四年七月(1168)，建康水; 乾道六年五月(1170)，建康水;淳熙十一年(1184)，建康雨水;光宗绍熙五年(1194)，建康大水;宁宗嘉定十四年(1221)，建康大水。”宋天禧二年(1018)以昇州为江宁府，建炎三年改称建康府。江宁、建康皆是南京旧称。
玄武湖在宋熙宁年间(1068-1077)被废为田，在此之前的4次水灾均由江水泛滥而起，具有流域性质。之后的10次水灾，除1118年记录为“江淮水”外，其次6次均为建康水或建康大水，具有鲜明的地域特征。特别的是，记录了3次大雨水。以上说明玄武湖被废后导致调蓄功能丧失，城市防洪能力下降而引发大水。入志者无小事，霖雨记入方志，连绵多日的雨水都能引发水患，这说明复湖更显迫切。
“元成宗元贞元年五月(1295)，建康水;大德二年(1298)建康水;仁宗延祐元年(1314)，建康大水;泰定帝泰定元年(1324)，江东水; 文宗至顺元年七月(1330)，江南水; 顺帝至正九年七月(1349)，大霖雨，江溢。”
元大德五年(1301)十一月前，集庆路(今南京)在四年内发生了两次大水，这促使官府“开后湖河道”。此后又发生了三次洪水，元至正三年(1343)四月，又“开浚后湖河道，上至钟山乡珍珠桥，下接金陵龙湾大江，通十七里。”规模比上一次大得多。但这两次均立足于疏浚“后湖河道”，比明洪武初年的浚湖力度要小得多。
天下图籍府
明朝初年定都金陵之后，为绝水患，保证京师安全，“明洪武元年(1368)九月，浚后湖。”玄武湖的回归显著提高了防洪能力。“明太祖洪武九年五月(1376)，水溢。”这引起了朱元璋的高度重视。“胡尘汛扫八方清，玉辇曾来此地行。不作神山遗嗣主，深藏图籍重苍生。”明朝正德年间南京户部主事黄希英用《咏后湖并跋》描述了明初朱元璋到玄武湖调研的场景，可见朱元璋对玄武湖的使用有了新的考虑。
根据《明史》《龙江船厂志》和《后湖志》记载，明洪武十四年(1381)正月，诏天下编赋役黄册，是年梁洲建册库9间，收藏天下黄册;洪武二十四年(1391)，浚京城(今南京老城)后湖，乃复蓄水为浸。这一次疏浚结合黄册库的建设，采取了干湖方式。至此玄武湖的洲岛格局形成并延续至今。这一年梁洲建南、北库25间，天下郡县赋役黄册成，计53393本。也正是这次清淤，“建康大水”在方志中消失了近百年，直到明成化元年七月(1465)才见“应天水灾”的记载。
消失300余年之后，玄武湖成为明朝后湖黄册库，被列为禁地。又经过600余年的城市演变，除了北面边界有所收缩外，玄武湖东面、南面、西面因太平堤和明城墙的存在还保持着明初的界限，湖中的洲岛格局也未改变，这不能不说是一个奇迹。
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